شیمی در علوم زیستی

Chemistry for Biology

مقطع: تحصیلات تکمیلی گرایش: بیوانفورماتیک
نوع درس: نظری تعداد واحد: ۳
پیش‌نیاز: – هم‌نیاز: –

هدف کلی

هدف از این درس، آشنایی با مبانی شیمی و کاربرد آن‌ها در سیتم‌های زیستی و همچنین کاربرد آن‌ها در روش‌های شبیه‌سازی و طراحی دارو با استفاده از نرم‌افزارهای براساس روش‌های مکانیک کوانتومی و مکانیک مولکولی است.

سرفصل‌ها

  1. نظریه اتمی
  2. ساختار مولکولی، پیوند و شکل
  3. انرژی و آنتالپی
  4. گازها
  5. خواص محلول
  6. تعادل
  7. اسیدها و بازها، سینتیک
  8. الکتروشیمی
  9. جایگزینی هسته دوستی
  10. واکنش‌های حذفی
  11. رادیکال‌های آزاد
  12. پلیمرها
  13. نرم‌افزارها: مدل‌سازی مولکولی
    • بهینهسازی ساختار دارو، برهم‌کنش بین مولکولی، برهم‌کنش بازهای دی ان ای
    • برهم‌کنش دارو و پروتئین

ارزیابی پیشنهادی

منابع پیشنهادی

  1. M. Silberberg and P. Amateis. Chemistry: The Molecular Nature of Matter and Change. McGraw Hill, 8th Edition, 2017.
  2. J. Smith. Organic Chemistry. McGraw Hill, 6th Edition, 2019.
  3. Computational Chemistry Softwares.